《风中的女王 第二季》故事讲述刚刚登上国王和王后宝座的Francis和Mary面临一种前所未有的棘手情况：黑死病瘟疫正在欧洲大陆快速蔓延，法国宫廷内外都陷入混乱。不仅人民的生命受到威胁，Francis和Mary的统治也难以得到稳固。更糟的是，当Mary下令关闭城门封锁城堡的时候，Francis正身处城门之外。他试图带Lola一起安全返回城堡。一些令人畏惧的新面孔出现在法国宫廷内，他们全都对权力垂涎三尺，Mary和Catherine感到了巨大的压力。与此同时，Kenna和Bash分开了，Kenna面临生命危险。Greer被迫看着Leith和一个新情人卿卿我我，然而让她感到震惊的是，他正和她未婚夫的女儿暧昧不清......