查尔斯城被付之一炬，新世界的所有人都对Flint船长产生深深的恐惧。为了给死去的Miranda复仇，Flint发誓要向所有当权者开战。当他的恐怖行径演变成疯狂之举后，只有John Silver能唤醒他的人性……否则一切都太迟了。与此同时，Eleanor Guthrie被关进了监狱，Jack Rackham监管着全新的拿索。他野心勃勃第想要当强盗之王，得到自己应得的财富和地位。拿索开始确立一种新的三权分立格局，但拿索的生存取决于他们是否能尽快重建堡垒，同时保护所有被盗的西班牙金币。Eleanor等待着审判，她唯一的希望是一个奇怪的盟友。当一个远远超乎这群海盗想象的新威胁出现后，这一切都面临严峻考验。这个新威胁知道他们的一切，也理解他们的一切。在眨眼之间，这股力量使他们开始自相残杀。