新学期刚开始，高中生坂井悠二一如往常过着「日常」生活。然而有一天，他冷不防遭遇到「异常」的侵袭 - 受到一名能把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。
悠二的「日常」生活因此整个脱节，然而就在同一时间，一名少女出现在他面前。少女为了保护悠二不被法利格尼袭击，开始与他一同生活。悠二满怀感激向少女道谢，不料少女却向他低声说道：「你已经『不存在』了。」