《天使领域Angelic Layer》混合了育成游戏、格斗游戏、模型多种元素故事讲述铃原美咲来到东京升上初中一年级，在街上看到了被称为“天使”的战斗场面，便被“她”深深吸引着，而一位神秘男子，他自称阿一，说着要教导美“育成”自己的“天使”。
　　美咲在购买“天使之卵”之后，便高高兴兴到了阿姨家里寄宿，并打开了“天使之卵”，开始“育成”她，“制作”完成后，美为她取了小光这个名字。第二天，美正式在东京上学，不久便认识了一对青梅竹马的好朋友虎太郎及珠代，他们三人很快便成了好朋友。
　　之后自称阿一的男子再度出现，并带着美去学习如何用“意念”控制小光与参赛者在“天使领域”内行动战斗，更硬把她找去参加格斗比赛......
　　操纵心爱的天使在领域中战斗，谁是最终的王者？