燕雀侦探社是一个专门接受不可思议事件的地方。是由化身为邪神的少年侦探洛奇和助手暗野龙介打理。有一天，女高中生大堂寺繭良来到侦探社委托他们帮助一个会说话的洋娃娃找寻它的主人。经过调查，原来那个洋娃娃的主人是一个已经在10年前一场大火中死去的小女孩的，而且那个洋娃娃已经被邪力控制了。就在洋娃娃要伤害大堂寺时，洛奇及时赶到，并最后消除了洋娃娃身上的邪力。事件过后，大堂寺没有经洛奇同意就做了他的助手，一起处理那些不可思议事件.....
大堂寺所在的学校举办学园祭，在学园祭上大堂寺遇到了带着木刀的神秘少年鸣神.......洛奇也被拉来解决所谓的“校园7大不可思议事件”(怎么和《金田一》一样有“校园7大不可思议事件”........），在揭开了6大事件的面纱后，在第7大不可思议事件——铠甲武士前再次遇到了鸣神。洛奇在铠甲上感到了一股邪气。晚上洛奇他们再次来到学校调查，在调查过程中遇到了铠甲的袭击，洛奇轻松的解决了铠甲。铠甲武士的配剑正好落在了大堂寺的身边，她不由自主的拿了起来，于是被剑所控制了，并且再次袭击洛奇。原来那把剑，竟然是一把魔剑。就在洛奇危险时，鸣神出现并击毁了那把剑，原来鸣神竟然是来到人间的雷神......
随后还相继出现了策略之神，丰收女神等众神，有的是为了杀洛奇而来，有的则是为了保护洛奇