她们是在世界有最高层的特异功能的3个少女，她们解决着各种各样的事件的。
在不久的将来，超能力者的存在已成为理所当然的事情，然而超能力者与普通人的隔阂却未完全消失。年轻的天才科学家皆本光一，肩负起照顾拥有最强超能力的三名少女——明石熏、三宫紫穗和野上葵，她们不分日夜，在内务省特务机关的超能力支援研究局（通称BABEL）旗下从事着危险任务。皆本光一的任务就是引导她们走向正途，成为对国家的有用之才。但面对这三个早熟又超级任性的女孩，皆本每天都烦恼不已……