在经历长久的血腥战斗后，来到和平的这个时代。在「ZOIDS BATTLE」－「机兽格斗赛」中，能将巨大的机兽操作自如，展现华丽的战斗竞技的这些战士们，被称为「ZI强者」，被众人所憧憬崇拜。「ZI强者」画分为许多联盟，主角ＲＤ，是隶属于「极速风暴」，操作着父亲遗留下来机兽的ZI强者之一，梦想着未来能有一天，找出父亲对他提过的传说中的机兽…。